בעיית הבטיחות הגדולה ביותר בלייזר היא הנזק הפוטנציאלי לעיניים ולעור אנושיים.
לייזרים פולטים קרן אור מרוכזת שעלולה לגרום נזק לרשתית העין ולעור אם לא ננקטים אמצעי בטיחות נאותים. זו הסיבה שחשוב להשתמש במשקפי לייזר מגן ולפעול לפי הנחיות היצרן בעת הפעלת לייזר.
בנוסף, לייזרים עלולים לגרום לשריפות או פיצוצים אם משתמשים בהם בצורה לא נכונה, מה שמחייב לטפל בהם בזהירות.
עם זאת, כל עוד ננקטים אמצעי בטיחות, לייזרים יכולים להיות כלי בטוח ושימושי להפליא עבור מגוון יישומים בתעשיות כמו רפואה, ייצור ומחקר.